鲸鲨是一种滤食动物。觅食时，它们张开大嘴，将富含浮游生物的海水吞入口中，而后闭上嘴，打开鳃盖，利用鳃上类似牙齿的肤齿充当一个筛子，捕获尺寸超过2到3毫米的浮游生物。